تنظم اليابان في 47 محافظة مجمعة في ثماني مناطق تقليدية تمتد من هوكايدو في الشمال إلى أوكيناوا في الجنوب، مشكلة أرخبيلًا بركانيًا من أكثر من 3000 جزيرة في المحيط الهادئ. طوكيو هي المحافظة الحضرية الأكثر سكانًا بأكثر من 14 مليون نسمة، وأكبر منطقة حضرية في العالم بأكثر من 37 مليونًا، والبلد شديد التعرض للزلازل مع خرائط مخاطر تحدد مناطق التميّع والتسونامي والأعاصير خاصة في كيوشو وأوكيناوا. المناطق الثماني هي هوكايدو وتوهوكو كانتو وتشوبو وكينكي وتشوغوكو وشيكوكو وكيوشو-أوكيناوا، لكل منها خصائص جغرافية واقتصادية مميزة. في نسخة Risk هذه، هونشو هي الجزيرة المركزية التي تربط الشمال بالجنوب وتتركز فيها معظم السكان والصناعة، وهوكايدو جناح شمالي مع وصول إلى روسيا، وكيوشو وأوكيناوا بوابتان نحو كوريا والصين والمحيط الهادئ الجنوبي، والبحر الداخلي لسيتو هو طريق بحري حيوي يربط بحر اليابان بالمحيط الهادئ. يمنحك التحكم في ممر طوكيو-أوساكا-ناغويا المحور الاقتصادي للبلاد، ومن يسيطر على مضيقَي تسوشيما وتسوغارو يتحكم في المداخل البحرية الرئيسية.